
Q1. 건강보험료 연말정산제도가 개선됐다고 하는데.
A1. 2025년에는 간이지급명세서(근로소득)와 보수총액통보서를 병행해 연말정산을 처리했으나, 올해부터는 국세청에 ‘간이지급명세서(근로소득)’를 제출한 사업장은 사용자 별도 신고 없이 직장가입자의 건강보험료 연말정산이 자동으로 처리된다. 지난해 연계정산에서 제외됐던 공무원과 교직원이 가입된 사업장 또한 간이지급명세서로 자동 정산된다.
※ 연말정산이란? 전년도 보수총액을 기준으로 부과된 보험료를 실제로 받은 보수총액으로 재산정하고 보험료 차액을 추가 부과 또는 환급하는 제도.
Q2. 국세청 간이지급명세서 연계정산 제외 신청이 필요한 경우도 있나.
A2. 사용자가 국세청에 근로소득 간이지급명세서를 제출하지 않았거나, 공단과 국세청의 보수의 범위가 다른 경우 등으로 자동 정산을 희망하지 않는 사업장은 전자데이터교환(EDI) 신청 또는 공단 누리집을 통해 ‘간이지급명세서 연계정산 제외 신청서*’를 작성해 공단에 제출해야 한다. 이 경우 보수총액통보서를 3월10일까지 제출해야 하며, 연계정산 제외 신청 기한은 1월31일(단, 토요일인 경우 다음 영업일)까지다.
* 서식 : 지사 민원실 비치 또는 공단 누리집(www.nhis.or.kr)→정책·제도→자료실→서식자료실 게시
※ EDI 신청 경로: 신고/제증명 바로 가기→신고/신청→건강보험료→연말정산 간이지급명세서 연계정산 제외(취소) 신청
Q3. 연말정산보험료는 언제 반영되나.
A3. 2026년 4월분 건강보험료에 반영된다. 만약 지난해에 보험료를 더 많이 냈다면 환급받게 되고, 덜 낸 보험료가 있다면 추가 납부를 해야 하며, 연말정산 결과에 의한 보수월액은 2026년 4월부터 2027년 3월까지 반영된다.
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